色叶旷课逃学，绯闻不断，而且自有恃美貌而目中无人，简直集三次元女生讨人厌的地方于一身。对方迷人的外表令他心慌意乱，虽然讨厌可又着迷。几经周折，色叶向他表白，然而筒井粗鲁地拒绝了。另一天，筒井尾随色叶而行，结果目击到色叶被人冤枉盗窃的场面。关键时刻，筒井挺身而出，帮助女孩化解危机。随后他原本打算就之前的事情道歉，谁知脱口而出竟是“请和我交往”的话语。从这天起，筒井和色叶成为校园中一对受人指指点点的异样情侣…… 本片根据那波麿的同名漫画改编。
在新的故事中，神秘动物学的组织“皇帝组织”将勇敢面对这只巨型怪物，强大的哥斯拉也将与门兹拉、拉顿及其死敌基多拉三王展开激烈对抗。当这些传说中的超级生物再次崛起时，他们将进行皇室斗争，人类的命运岌岌可危
故事以当代日本为背景，妙子和丈夫二郎与她的儿子敬太本过着平静的生活，但当一场悲惨事故将男孩多年未见的生父朴带回到她的生活中时，妙子决定帮助这个无家可归的聋哑人，以弥补内心的痛苦和内疚。
